学院设有作物学博士后流动站、作物学一级学科博（硕）士点，以及作物栽培学与耕作学等7个二级学科博（硕）士点和生态学二级学科硕士点。此外，学院还设有农学、农村区域发展2个本科专业方向和农学（农业信息技术）专业方向，其中农学专业为江苏省首批品牌专业和国家特色专业建设点。
重点学科方面，作物栽培学与耕作学是国家级重点学科，起源于1902年著名实业家张謇先生创办的江海农学堂，并于20世纪60年代开始招收研究生。经1981年、1998年和2003年的学位授予权，以及2006年被确定为国家级重点学科。同时，农产品质量安全及其控制方向于2005年被遴选为江苏省重点（交叉）学科。
农学专业方面，江苏农学院等高校在农业教育领域的发展与进步值得肯定，并将继续坚持特色和优势，努力提高人才培养质量，培养更多优秀人才，为农业现代化建设贡献智慧和力量。
